根が深い（読み）ねがふかい

精選版 日本国語大辞典

ね【根】 が 深(ふか)い

1. 物事がそうなる原因が奥底にあって簡単には除けない状態である。根深い。
   1. [初出の実例]「愛著の道、その根ふかく、源とほし」(出典：徒然草（1331頃）九)

出典　精選版 日本国語大辞典